Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syde2E9PUP1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syde2E9PUP1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syde2E9PUP1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syde2E9PUP1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms