Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cngb1E1AZ71 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cngb1E1AZ71 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cngb1E1AZ71 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Cngb1E1AZ71 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cngb1E1AZ71 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms