Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl3E0CZ16 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl3E0CZ16 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klhl3E0CZ16 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl3E0CZ16 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl3E0CZ16 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl3E0CZ16 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl3E0CZ16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl3E0CZ16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl3E0CZ16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms