Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lonrf1D3YY23 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lonrf1D3YY23 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lonrf1D3YY23 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms