Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Samd1D3YXK1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samd1D3YXK1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd1D3YXK1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.8 ms