Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3259D3YUK0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3259D3YUK0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3259D3YUK0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
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