Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A930018M24RikB7ZMY3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A930018M24RikB7ZMY3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A930018M24RikB7ZMY3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms