Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcb5B5X0E4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb5B5X0E4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb5B5X0E4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms