Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce3B5KM66 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce3B5KM66 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syce3B5KM66 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms