Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5483B2RV77 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5483B2RV77 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5483B2RV77 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5483B2RV77 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms