Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Phactr2B1AVP0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phactr2B1AVP0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms