Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtpruB1AUH1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PtpruB1AUH1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PtpruB1AUH1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PtpruB1AUH1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PtpruB1AUH1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms