Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm438B1ASB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm438B1ASB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms