Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930435E12RikA6X8Z9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930435E12RikA6X8Z9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms