Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r232A2RTT5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r232A2RTT5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r232A2RTT5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms