Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al1jA2BFR3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al1jA2BFR3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms