Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hacd4A2AKM2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd4A2AKM2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hacd4A2AKM2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms