Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbf1A2A870 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbf1A2A870 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbf1A2A870 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbf1A2A870 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbf1A2A870 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbf1A2A870 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fbf1A2A870 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbf1A2A870 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbf1A2A870 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms