Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calcoco2A2A6M5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Calcoco2A2A6M5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calcoco2A2A6M5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Calcoco2A2A6M5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms