Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo47A2A6H3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo47A2A6H3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo47A2A6H3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms