Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp1bA1Z198 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp1bA1Z198 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms