Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfap99A0A140LIX9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap99A0A140LIX9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap99A0A140LIX9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap99A0A140LIX9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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