Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2210011C24RikA0A087WQ89 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2210011C24RikA0A087WQ89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms