Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms