Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AmfrQ9R049 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms