Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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