Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc97Q9DBT3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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