Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms