Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms