Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Derl3Q9D8K3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms