Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Zc2hc1bQ9D534 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zc2hc1bQ9D534 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms