Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rpl11Q9CXW4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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