Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup155Q99P88 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms