Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TrabdQ99JY4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TrabdQ99JY4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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TrabdQ99JY4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TrabdQ99JY4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TrabdQ99JY4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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