Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csmd1Q923L3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms