Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms