Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atl3Q91YH5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms