Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cdc34Q8CFI2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cdc34Q8CFI2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdc34Q8CFI2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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