Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp27Q8CEG8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp27Q8CEG8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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