Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klhl11Q8CE33 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms