Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lrsam1Q80ZI6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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