Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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