Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc18Q640L5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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