Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms