Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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