Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mier3Q3UHF3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms