Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms