Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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