Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah1bQ06985 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah1bQ06985 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms