Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp11Q02853 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp11Q02853 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms